Con su valor científico e histórico, el museo ha sido reconocido como uno de los más completos de su género en América Latina con más de 65.000 ejemplares en exhibición permanente.

El museo de CIENCIAS NATURALES LA SALLE cuenta con una variedad de campos, que incluye la sección de paleontología con los grandes dinosaurios. Sección de zoología: con los módulos de invertebrados (corales, artrópodos), de vertebrados (peces, reptiles, aves. mamíferos). Y las secciones de esqueletos, de arqueología y de fósiles.

Destaca especialmente la colección de conchas y mariposas.

El Museo La Salle es un proyecto cultural al servicio de la comunidad, en especial de la comunidad educativa, que conserva, investiga y muestra patrimonios naturales y culturales de nuestra Patria y de la humanidad, fomenta el amor a la naturaleza y la responsabilidad por la conservación de los recursos naturales y las especies en vías de extinción.

El Museo La Salle quiere ser el museo que invita a conocer de cerca, a través del recorrido por la salas de exhibición, el patrimonio natural, científico y cultural de Costa Rica. Se propone promover actividades educativas mediante proyectos de investigación, conservación y exposición en los diversos ambientes educativos.